Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P20040 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P20040 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P20040 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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