Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms