Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NelfeP19426 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms