Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms