Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18524 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18524 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18524 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18524 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18524 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms