Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpraP18052 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpraP18052 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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