Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfb3P17125 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgfb3P17125 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms