Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme1P15532 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme1P15532 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms