Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rplp0P14869 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms