Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms