Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms