Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms