Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2aP12399 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctla2aP12399 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms