Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga5P11688 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga5P11688 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms