Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DmdP11531 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DmdP11531 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DmdP11531 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DmdP11531 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DmdP11531 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DmdP11531 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DmdP11531 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DmdP11531 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DmdP11531 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DmdP11531 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms