Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Parp1P11103 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Parp1P11103 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Parp1P11103 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms