Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spp1P10923 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms