Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Amd1P0DMN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms