Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NefmP08553 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NefmP08553 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NefmP08553 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NefmP08553 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NefmP08553 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefmP08553 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefmP08553 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefmP08553 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NefmP08553 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms