Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApoeP08226 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms