Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TtrP07309 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TtrP07309 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
TtrP07309 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TtrP07309 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms