Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrlP06879 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrlP06879 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrlP06879 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrlP06879 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrlP06879 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrlP06879 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrlP06879 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrlP06879 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrlP06879 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PrlP06879 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrlP06879 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrlP06879 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrlP06879 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrlP06879 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrlP06879 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrlP06879 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrlP06879 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms