Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnfP06804 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnfP06804 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnfP06804 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnfP06804 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnfP06804 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnfP06804 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnfP06804 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnfP06804 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms