Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P06336 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06336 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06336 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06336 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06336 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms