Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms