Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04212 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04212 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04212 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04212 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P04212 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P04212 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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