Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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