Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt1P04104 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms