Protein–RNA interactions for Protein: P03911

Mtnd4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd4P03911 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd4P03911 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms