Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamc1P02468 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamc1P02468 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms