Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HbaP01942 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HbaP01942 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HbaP01942 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HbaP01942 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HbaP01942 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HbaP01942 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HbaP01942 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HbaP01942 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HbaP01942 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HbaP01942 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms