Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-AaP01910 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms