Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms