Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01822 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01822 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01822 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01822 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01822 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01822 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms