Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01809 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01809 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01809 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01809 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01809 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01809 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01809 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01809 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01809 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01809 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms