Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01678 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01678 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01678 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01678 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P01678 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01678 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01678 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01678 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01678 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01678 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01678 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01678 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01678 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01678 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms