Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01667 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01667 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01667 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01667 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01667 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms