Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01657 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01657 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01657 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01657 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01657 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01657 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01657 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01657 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01657 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01657 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01657 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01657 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms