Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01655 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01655 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01655 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01655 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01655 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01655 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms