Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Casp8O89110 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms