Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl2O89104 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms