Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms