Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms