Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtssO70370 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtssO70370 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtssO70370 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtssO70370 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms