Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms