Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb5O70309 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms