Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms