Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk2a2O54833 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms