Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp10aO54827 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms