Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elovl3O35949 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elovl3O35949 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms